Santa Catarina sempre se destacou como um dos estados mais inclusivos do Brasil. Em 1968, o estado foi pioneiro ao criar a Fundação Catarinense de Educação Especial, primeira instituição pública estadual do país responsável pela definição e coordenação de políticas de Educação Especial.
A FCEE tem como missão definir e coordenar a Política de Educação Especial do Estado de Santa Catarina, fomentando, produzindo e disseminando o conhecimento científico e tecnológico, para a inclusão, acesso e igualdade de oportunidades ao público da educação especial.
Em seu campus em São José, na Grande Florianópolis, a FCEE conta com dez Centros de Atendimento Especializado, que são espaços de estudos, discussões, atendimentos e pesquisas em suas respectivas áreas de atuação. A clientela dos Centros é composta por pessoas com atraso global do desenvolvimento, deficiência (visual, auditiva, intelectual, física e múltipla), transtorno do espectro autista, transtorno do déficit de atenção/hiperatividade e altas habilidades/superdotação.
Em todas as regiões do Estado de Santa Catarina, a FCEE mantém parcerias com instituições especializadas em educação especial para o atendimento pedagógico, beneficiando cerca de 31 mil educandos com deficiência. Os programas de parcerias incluem repasses financeiros para contratação direta de profissionais e manutenção das atividades das instituições (Gente Especial) e cedência de professores.
A FCEE é responsável ainda pela análise e autorização da implantação de serviços especializados em educação especial nas escolas da rede estadual de ensino (segundo professor de turma, professor bilíngue, professor intérprete, professor instrutor da LIBRAS e atendimento educacional especializado), através de parceria com a Secretaria de Estado da Educação, beneficiando cerca de 30 mil alunos.
O binômio produção e disseminação do conhecimento demanda ainda da FCEE a atuação na capacitação dos profissionais que atuam direta ou indiretamente com o público da educação especial em Santa Catarina. Assim, a FCEE disponibiliza cursos, capacitações e assessorias técnicas nos formatos presencial e à distância, voltados principalmente para os profissionais atuantes nas instituições parceiras e nas escolas da rede regular de ensino.